Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syce1lQ5D525 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms