Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmtc2Q56A06 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmtc2Q56A06 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms