Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrig2Q52KR2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrig2Q52KR2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms