Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd28Q505D1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd28Q505D1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms