Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otol1Q4ZJM7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otol1Q4ZJM7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms