Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srek1ip1Q4V9W2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms