Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Khdc1cQ4KL78 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Khdc1cQ4KL78 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms