Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt35Q497I4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms