Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmub2Q3V209 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms