Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc185Q3V118 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms