Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp48Q3V0C5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp48Q3V0C5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms