Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc27Q3V036 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc27Q3V036 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms