Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E330034G19RikQ3UWX6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E330034G19RikQ3UWX6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms