Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn4Q3UV66 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn4Q3UV66 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms