Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chpf2Q3UU43 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chpf2Q3UU43 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms