Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syndig1lQ3USQ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms