Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TceancQ3US16 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TceancQ3US16 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms