Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Arhgef40Q3UPH7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgef40Q3UPH7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgef40Q3UPH7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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