Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem253Q3UNB8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem253Q3UNB8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms