Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog7Q3UM29 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cog7Q3UM29 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms