Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc33Q3ULW6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms