Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pin1rt1Q3ULQ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pin1rt1Q3ULQ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms