Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctsll3Q3ULP7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctsll3Q3ULP7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms