Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CrxosQ3UL53 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CrxosQ3UL53 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms