Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp19Q3UJD6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp19Q3UJD6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms