Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJC8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3UJC8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q3UJC8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms