Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b2Q3UJB0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms