Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc34Q3UI66 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms