Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Greb1Q3UHK3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms