Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Arfgef3Q3UGY8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Arfgef3Q3UGY8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Arfgef3Q3UGY8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Arfgef3Q3UGY8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Arfgef3Q3UGY8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Arfgef3Q3UGY8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Arfgef3Q3UGY8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Arfgef3Q3UGY8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Arfgef3Q3UGY8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arfgef3Q3UGY8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms