Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rrp36Q3UFY0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp36Q3UFY0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms