Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam35aQ3UEN2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam35aQ3UEN2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms