Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Puf60Q3UEB3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Puf60Q3UEB3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Puf60Q3UEB3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms