Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf180Q3U827 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf180Q3U827 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf180Q3U827 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms