Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q3U7U4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3U7U4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms