Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3U6N9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3U6N9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms