Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
VwceQ3U515 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VwceQ3U515 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms