Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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