Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gse1Q3U3C9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gse1Q3U3C9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms