Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc174Q3U155 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc174Q3U155 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms