Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn4clQ3TYX2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn4clQ3TYX2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn4clQ3TYX2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn4clQ3TYX2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Lrrn4clQ3TYX2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Lrrn4clQ3TYX2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Lrrn4clQ3TYX2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lrrn4clQ3TYX2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrn4clQ3TYX2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms