Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccndbp1Q3TVC7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms