Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Fndc4Q3TR08 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Fndc4Q3TR08 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fndc4Q3TR08 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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