Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Calr4Q3TQS0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Calr4Q3TQS0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms