Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XylbQ3TNA1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XylbQ3TNA1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms