Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc102aQ3TMW1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms