Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cwc27Q3TKY6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cwc27Q3TKY6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms