Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xlr4cQ3TKR2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xlr4cQ3TKR2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms