Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fubp3Q3TIX6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fubp3Q3TIX6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms