Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc13Q3TIR1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms